Анализ кишечной микробиоты может указать город вашего проживания с точностью 94 %
Открытие китайских исследователей из компании BGI Genomics переворачивает представления о возможностях идентификации личности. Оказалось, что состав кишечной микрофлоры человека может указать на место его проживания с точностью до конкретного города — причем даже в пределах одной провинции. Специалисты BGI Genomics провели масштабное исследование микробиома 381 жителя двух китайских городов — Уханя и Шияна, расположенных в пятистах километрах друг от друга. Используя технологию метагеномого секвенирования, исследователи обнаружили присутствие в образцах 649 видов бактерий и более 500 метаболических путей, демонстрирующих статистически значимые различия между жителями этих населенных пунктов.
«Наши результаты опровергают устоявшееся мнение, что различия в микробиоме проявляются только на уровне континентов или стран», — отмечает профессор Ли Тао, ведущий автор исследования. Так, анализ показал, что уханьцы имеют повышенное содержание Bacteroides stercoris, что связано с метаболизмом растительной пищи. В то время как у жителей Шияна преобладает Prevotella copri — бактерия, характерная для рационов с высоким содержанием белка. Ученые связывают эти различия с местными пищевыми традициями: в Ухане популярны блюда из пресноводной рыбы и листовой зелени, а Шиян демонстрирует любовь к пикантным мучным изделиям.
Разработанная ИИ-модель, берущая в расчет дюжину метаболических путей и 16 видов бактерий, смогла определить родной город каждого участника, показав точность 94 %. Этот показатель значительно лучше, чем результаты моделей, опирающихся только на видовой состав бактерий или только пути метаболизма. Несмотря на ограничения, возникшие из-за неравномерного гендерного распределения участников и отсутствия данных о питании, новая методика делает возможной идентификацию человека по микробиому, персонализированный подбор пробиотиков и региональный мониторинг здоровья населения.